Der Ort Sipperhausen wurde 943 erstmals als Wüstung "Swidburg" genannt, wobei zu vermuten ist, das schon Jahrhunderte der Urbarmachung vorausgegangen waren.

im Jahr 1142 ist Sipperhausen unter dem Namen "Swipergehusen" erwähnt. Sipperhausen liegt auf dem Höhenzug Efze/Eder und Beisetal, zwischen Homberg/Efze und Melsungen. Zur Gemeinde gehört auch die Siedlung Bubenrode, ein ehemals seit 1377 dem Adelsgeschlecht von Malsburg eigenem Rittergut.

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